Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms