Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD1Q9UIS9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms