Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms