Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms