Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms