Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMG20AQ9NP66 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms