Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms