Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms