Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2AFJQ9BTM1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms