Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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