Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms