Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CDRT15Q96T59 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms