Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIN3AQ96ST3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms