Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AGAP4Q96P64 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms