Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms