Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms