Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms