Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms