Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPC24Q8NBT2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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