Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms