Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms