Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF7Q6Q0C0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms