Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LETMD1Q6P1Q0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms