Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms