Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms