Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG9BQ674R7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms