Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SAMD13Q5VXD3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms