Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM208BQ5VWN6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms