Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms