Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms