Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNT1Q5JUK3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms