Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms