Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKOR2Q2VWA4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms