Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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