Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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