Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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