Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms