Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NTRK3Q16288 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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