Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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