Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS72Q15906 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS72Q15906 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS72Q15906 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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