Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITSN1Q15811 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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