Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF11Q15544 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms