Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SS18Q15532 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms