Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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