Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSPNQ14714 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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