Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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