Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCIRG1Q13488 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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