Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHIT1Q13231 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms