Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF2Q12947 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms