Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms